随着人民生活水平的提高，对乳制品和肉制品的需求日益增加，推动了畜牧产业的发展，出现了大量的规模化的畜牧场（小区），生产规模由以前的几十头发展到几百头、几千头。这种规模化的集中饲养方式，有利于提高畜禽的饲养技术、防疫能力和管理水平，与传统农户分散饲养相比，规模化饲养能大大提高生产效率和饲养转化率，降低生产成本，从而增加经济效益。但这种生产方式造成了粪尿过度集中和冲洗水大量增加，给环境带来了极大的压力，如果不加以妥善处理，会严重影响到畜牧业的可持续发展。
近年来，农业污染治理已列入重要议事日程。农业污染与工业污染、城市生活污水并列为三大污染源，而畜禽粪便又是导致农业污染的主要因素之一，因此加强畜禽养殖环境建设对于治理农业污染、改善生态环境质量具有重要意义。
畜禽粪便的COD(化学蓄氧量)的排放量超出了工业废水和生活污水的排放量。由于有规模的畜牧小区（场）处理能力和贮运能力不足，经过科学处理的粪便不足10%。在非用肥季节，畜禽粪便随意露天堆放，粪水四溢，直接导致农民生产生活环境恶化。首先是造成水体污染，畜禽粪便的随意排放造成水体的富营养化，渗入地下水可造成地下水硝酸盐含量过高；其次是传播疫病，目前由动物传染给人的人畜共患病有一百多种，传播的主要载体就是畜禽粪便。
从而严重威胁畜牧业产业的安全。可以说资源、环境已经成为畜牧业可持续发展的主要制约因素。
加强畜牧小区污染治理措施的重要意义有以下几个方面：
1、治理畜禽粪便污染是实施农业可持续发展战略的要求
实施可持续发展战略是我国的基本国策，可持续发展要求在经济发展的同时，治理环境污染，改善和提高环境质量。规模化养殖业的快速发展是以牺牲环境为代价的，这种发展模式是不可持续的，不符合可持续发展战略的要求。通过综合治理措施，在治理环境污染的同时，促进畜禽粪便的资源化利用，既解决污染问题，又改善土壤质量，从而达到农业可持续发展的目标。
2、畜牧污染防治是生态环境建设的一个组成部分
根据《全国生态环境建设规划》的总体安排，各部门都要对本行业在发展中出现的环境问题提出规划，分步实施，逐步加以解决。针对畜禽粪便污染对环境造成的严重危害，农业部制定了“能环工程”规划，在规模化养殖发展较为集中的地区，建设示范工程项目，提供技术和信息服务，以点带面，为加强畜禽养殖环境管理，提供有效解决污染问题，促进畜禽粪便资源化利用的有效途径。
3、治理污染，保护环境
禽畜粪便虽然是严重的污染源，但却又是可开发的宝贵资源。通过科学的处理和加工，便可转化为不可缺少的生产和生活资料。英国、德国、日本、美国和原苏联等国家早在50年代就利用厌氧、好氧和快速烘干等方法处理城市污水和人畜粪便，既治理了污染又获得了大量的有机肥料用于改良土壤。在工程中，禽畜粪便经过固液分离、厌氧、好氧及综合利用等环节的处理，排出液可以达到我国农田灌溉一级排放标准（COD≤200毫克/升），从而使项目区域的污染得到治理，根本上改善了生态环境。
4、开发可再生能源，提高广大农民的生活质量
综合治理措施所产沼气,作为一种可再生能源资源，无论是用做生活燃料，还是用于生产电力，都能够减少日益枯竭的化石能源的消耗，这对减低因化石燃料利用带来的全球气候变化具有一定的战略意义。
沼气又是一种高品位能源，在我国农村经济迅猛发展的今天，面对与衣、食、住相比能源消费相对落后的形势，高品位能源的开发利用适应了农户对生活条件改善的需求，为提高农民生活质量，农村建设实现小康的发展目标提供了能源保障。
此外，厌氧消化过程可以杀死各种寄生虫卵（如钩虫卵、蛔虫卵等）和多种致病菌，同时消除了恶臭，使蚊蝇失去了滋生场所，大大地降低了一些人畜共患的寄生虫和其它疾病的交叉传播的机率。因此，粪便无害化功能可显著的改善农村的卫生状况和生活环境。
5、增强畜禽养殖企业的可持续发展能力
通过粪污治理，养殖企业能够减少禽畜发病率，增加出栏量，并提高畜禽产品的质量等级。有材料表明，仅以上两项就可为企业增收约10%左右。此外，通过综合防治措施中的综合利用技术，还可利用废弃物生产优质的有机肥料和饲料等生产物资，为企业创造了多方面的经济效益，提高了畜禽饲养企业的生存发展能力。
6、合理利用资源，为生态农业发展增添了后劲
粪便一直是我国农业生产的主要有机肥源。但由于粪便需要肥料化处理，肥效慢，施用量大，运输、施用不便，施用季节受限制等，导致作为有机肥料的粪便没有得到充分的利用，而化肥的长期使用又导致了众所周知的农业生态环境恶化。
通过对粪便多层次、多途径的转化，逐步地使各畜牧（场）小区在发展养殖业的同时，又成为不同规模的有机肥生产厂，在控制环境污染，改善生态环境质量的同时，为农业生产提供大量的优质有机肥料，为无公害农产品的生产提供了肥源。
防治措施中对粪污的综合利用，可增加土壤的有机质含量，提高土壤肥力，改善土壤理化性状，减少农业生产对化学肥料的依赖，促进农业生态系统物质和能量的良性循环。
简言之，做为在我市农业生产中占有很大比重的畜牧业，在发展肉、蛋、奶等生产的同时，亦必须着手开展畜禽粪便的处理和资源化利用，这既是实施可持续发展战略的要求，也是全国生态环境建设的一个组成部分。因此，为促进农村经济健康、稳定、持续的发展，有计划、有步骤地在畜禽养殖场、畜牧小区开展污染综合防治措施建设势在必行。