霉菌毒素对蛋鸡的影响集中表现在：卵巢和输卵管萎缩，产蛋量下降，产畸形蛋，采食量减少，生产性能下降，饲料报酬率降低，种蛋的孵化率降低。不同霉菌毒素对蛋鸡造成的危害有所区别。在已经知道的霉菌毒素中对蛋鸡影响及毒害作用较大的有麦角毒素、单端孢霉毒素、腐马毒素、玉米赤霉烯酮、黄曲霉毒素、赭曲霉毒素等。
麦角毒素 由麦角毒素引起的蛋鸡中毒以血管、神经和内分泌紊乱为特征，产蛋鸡麦角中毒表现为采食量减少，产蛋率下降，排稀粪等。
腐马毒素 由串珠镰刀菌分泌。蛋鸡的中毒症状表现为拉稀、排黑色黏性粪便，采食量减少，体重减轻，肢体残废，死亡率提高。体外试验证明，腐马毒素对巨噬细胞和淋巴细胞有毒性作用，可降低免疫细胞的杀菌活性。
玉米赤霉烯酮 玉米赤霉烯酮主要由禾谷镰刀菌产生，粉红镰刀菌、三线镰刀菌等多种镰刀菌也能产生这种毒素。蛋鸡中毒的临床表现为鸡冠肿大、卵巢萎缩、产蛋率下降，有的出现腹水症。
黄曲霉毒素 黄曲霉毒素是高毒性和高致癌性毒素，由黄曲霉菌、寄生曲霉和软毛青霉产生。它与细胞核和线粒体DNA结合，造成蛋白质合成受损，干扰肝肾功能，抑制免疫系统。蛋鸡临床表现为食欲不振、产蛋率下降、死亡率提高。剖检可见肝肾肿大、苍白，皮下出血，心包积水，胆囊扩张，卡他性肠炎;镜检可见肝脏脂肪变性、胆管增生。